今年7月房地合一稅制開啟2.0新時代，公司出售2016年後取得房地，須依持有時間採差別稅率計算房地合一稅。國稅局表示，企業房地合一稅制設有「盈虧互抵」機制，但房地交易損失只能抵減房地交易所得，且必須依據三步驟順序來減除。

現今所得稅法第39條中，就有設計十年盈虧互抵的規定，而這樣的概念也導入房地合一2.0稅制，採用分開計稅的這些房地交易損失，可以按順序用來抵減同樣是分開計稅的房地交易所得。

首先第一順位是當年度損失，應先從當年度適用「相同稅率」的房地交易所得中減除；第二順位，如果同稅率損失還有未減除的餘額，才可用來減除當年度不同稅率的房地交易所得。

舉例而言，甲公司在同一年度中，有適用20%稅率的房地交易損失，應該優先用來抵減20%稅率案件的所得，若減除後還有剩，才可用來抵減同年度適用45%稅率案件的所得。

前述兩種所得都減除後仍有餘額，第三順位才可自交易年度次年起十年內房地交易所得中減除。

財政部高雄國稅局表示，營利事業自今年7月起交易2016年元旦後取得的房屋、土地，雖然仍維持隔年5月報稅季時申報繳納，但計稅方式就要特別留意了。

如果是公司出售買入的房地，俗稱二手房地，就是按照持有期間來以差別稅率計算，採分開計稅，若兩年內出售稅率為45%，超過兩年未達五年稅率則為35%，超過五年則稅率為20%。

此外如果公司非起造人，只提供土地跟其他公司合建分屋後出售，也是採分開計稅，不過稅率以20%計算。

若是建商自地自建、與地主合建等情況，申請建物所有權第一次登記取得後出售，就排除在房地合一2.0適用範圍，仍維持合併計稅，也就是併入營利事業所得中，並依當年度營所稅率計算。